广深港高铁首站从番禺钟村镇石壁(即新火车客运站)出发,在番禺沙湾穿过青罗峰隧道(长2063米),由沙湾水道特大桥(长17999米)跨至南沙,路经鱼窝头、东涌,遁入狮子洋隧道直通东莞虎门;从虎门出发再经大岭山隧道(长4715米)、公明站特大桥(长1659米)直达公明,再由楼村特大桥(长4392米)、水田特大桥(长547米)、羊台山隧道(4772米)到达深圳龙华;最后,广深港铁路经过皇岗、落马洲、新田前往香港境内,并通过西铁到达最后终点站:西九龙站。