广深港高铁首站从番禺钟村镇石壁（即新火车客运站）出发，在番禺沙湾穿过青罗峰隧道（长2063米），由沙湾水道特大桥（长17999米）跨至南沙，路经鱼窝头、东涌，遁入狮子洋隧道直通东莞虎门；从虎门出发再经大岭山隧道（长4715米）、公明站特大桥（长1659米）直达公明，再由楼村特大桥（长4392米）、水田特大桥（长547米）、羊台山隧道（4772米）到达深圳龙华；最后，广深港铁路经过皇岗、落马洲、新田前往香港境内，并通过西铁到达最后终点站：西九龙站。